Nu har jag fixat det.
För er som ämnar göra likadant, så kommer lite stalltips.

Thor/Hotbird aktiverad på LNB0 med ingång A/A och disecq1.2 och Sirius/Astra aktiverad på LNB1 med ingång A/B och disecq1.2.

Kruxet var när man skulle ställa in motorplaceringarna. Där satte jag Thor på pos 1 och Hotbird på pos 2 (via LNB0).
Därefter satte jag även Sirius på pos 1 och Astra på pos 2 (via LNB1). Nu fungerar det att växla mellan Thor/Sirius och Hotbird/Astra utan att vänta på motorflytt.
/ Blizzard