Har för mig att jag hade liknande problem, men att det fungerade bättre när jag använde CSC istället för WinCSC. CSC har lite mer primitivt gränssnitt men verkar fungera stabilare.
Ett annat alternativ kan vara att använda acamd istället som många säger fungerar bra. Jag har dock inte kört den själv.
Det är klart att det fungerar smidigare med en Dreambox. Inga problem att köra mgcamd mot en NewCS-server, det fungerar helt utan strul. Men jag tror även att du kan få din ProgDVB-lösning att fungera bra om du testar lite andra plugins än WinCSC. Prova CSC eller acamd som jag skrev ovan. Om du söker på acamd här i forumet så tror jag du hittar en del exempel på folk som konfigurerat acamd för Boxer.
Själv kör jag satellit sedan några år tillbaka så jag kan inte testa några Boxer-grejer själv numera. Utan det jag skrivit i denna tråden är taget ur minnet sedan jag höll på med Boxer för några år sedan.
P.S. Har ett svagt minne av att det kanske fungerade med WinCSC om du går till en okodad kanal emellan. Alltså inte direkt ifrån Kanal 5 till MTV utan prova Kanal 5 -> SVT1 -> MTV om det går bättre?